Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GabpaQ00422 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GabpaQ00422 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GabpaQ00422 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GabpaQ00422 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GabpaQ00422 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GabpaQ00422 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GabpaQ00422 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GabpaQ00422 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GabpaQ00422 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GabpaQ00422 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GabpaQ00422 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GabpaQ00422 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GabpaQ00422 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GabpaQ00422 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GabpaQ00422 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GabpaQ00422 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GabpaQ00422 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GabpaQ00422 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GabpaQ00422 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GabpaQ00422 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GabpaQ00422 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GabpaQ00422 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GabpaQ00422 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GabpaQ00422 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GabpaQ00422 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GabpaQ00422 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GabpaQ00422 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GabpaQ00422 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GabpaQ00422 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GabpaQ00422 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GabpaQ00422 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GabpaQ00422 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GabpaQ00422 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GabpaQ00422 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GabpaQ00422 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GabpaQ00422 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GabpaQ00422 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GabpaQ00422 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GabpaQ00422 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GabpaQ00422 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GabpaQ00422 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GabpaQ00422 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GabpaQ00422 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GabpaQ00422 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GabpaQ00422 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GabpaQ00422 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GabpaQ00422 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms