Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scn1bP97952 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scn1bP97952 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scn1bP97952 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scn1bP97952 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scn1bP97952 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scn1bP97952 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scn1bP97952 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scn1bP97952 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scn1bP97952 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Scn1bP97952 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scn1bP97952 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scn1bP97952 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scn1bP97952 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scn1bP97952 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scn1bP97952 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms