Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cry1P97784 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Cry1P97784 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cry1P97784 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cry1P97784 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cry1P97784 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cry1P97784 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cry1P97784 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cry1P97784 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cry1P97784 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cry1P97784 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cry1P97784 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cry1P97784 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cry1P97784 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cry1P97784 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cry1P97784 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cry1P97784 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cry1P97784 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cry1P97784 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cry1P97784 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cry1P97784 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cry1P97784 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cry1P97784 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cry1P97784 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cry1P97784 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cry1P97784 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cry1P97784 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cry1P97784 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cry1P97784 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cry1P97784 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cry1P97784 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cry1P97784 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cry1P97784 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cry1P97784 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cry1P97784 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cry1P97784 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cry1P97784 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cry1P97784 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cry1P97784 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cry1P97784 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cry1P97784 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cry1P97784 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cry1P97784 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cry1P97784 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms