Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cited1P97769 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cited1P97769 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cited1P97769 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cited1P97769 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cited1P97769 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cited1P97769 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cited1P97769 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cited1P97769 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cited1P97769 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cited1P97769 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cited1P97769 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cited1P97769 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cited1P97769 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cited1P97769 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms