Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smarcc1P97496 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Smarcc1P97496 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarcc1P97496 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarcc1P97496 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarcc1P97496 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarcc1P97496 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarcc1P97496 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarcc1P97496 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarcc1P97496 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarcc1P97496 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smarcc1P97496 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Smarcc1P97496 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smarcc1P97496 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smarcc1P97496 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smarcc1P97496 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smarcc1P97496 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smarcc1P97496 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smarcc1P97496 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smarcc1P97496 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smarcc1P97496 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smarcc1P97496 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smarcc1P97496 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smarcc1P97496 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smarcc1P97496 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarcc1P97496 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarcc1P97496 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarcc1P97496 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarcc1P97496 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smarcc1P97496 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarcc1P97496 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarcc1P97496 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarcc1P97496 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarcc1P97496 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarcc1P97496 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smarcc1P97496 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smarcc1P97496 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Smarcc1P97496 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smarcc1P97496 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smarcc1P97496 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smarcc1P97496 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Smarcc1P97496 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Smarcc1P97496 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smarcc1P97496 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Smarcc1P97496 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smarcc1P97496 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smarcc1P97496 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarcc1P97496 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarcc1P97496 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarcc1P97496 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarcc1P97496 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarcc1P97496 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarcc1P97496 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarcc1P97496 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarcc1P97496 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarcc1P97496 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarcc1P97496 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarcc1P97496 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smarcc1P97496 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smarcc1P97496 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smarcc1P97496 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smarcc1P97496 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smarcc1P97496 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smarcc1P97496 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smarcc1P97496 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smarcc1P97496 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smarcc1P97496 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Smarcc1P97496 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smarcc1P97496 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarcc1P97496 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarcc1P97496 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarcc1P97496 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarcc1P97496 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarcc1P97496 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarcc1P97496 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarcc1P97496 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarcc1P97496 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Smarcc1P97496 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Smarcc1P97496 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smarcc1P97496 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smarcc1P97496 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smarcc1P97496 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smarcc1P97496 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smarcc1P97496 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smarcc1P97496 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smarcc1P97496 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smarcc1P97496 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarcc1P97496 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarcc1P97496 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarcc1P97496 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarcc1P97496 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarcc1P97496 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarcc1P97496 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarcc1P97496 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarcc1P97496 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarcc1P97496 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarcc1P97496 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarcc1P97496 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarcc1P97496 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarcc1P97496 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms