Protein–RNA interactions for Protein: P97368

Meis3, Homeobox protein Meis3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis3P97368 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Meis3P97368 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Meis3P97368 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Meis3P97368 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Meis3P97368 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Meis3P97368 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Meis3P97368 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Meis3P97368 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Meis3P97368 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Meis3P97368 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Meis3P97368 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms