Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Nkx2-3P97334 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nkx2-3P97334 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nkx2-3P97334 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nkx2-3P97334 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nkx2-3P97334 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nkx2-3P97334 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nkx2-3P97334 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nkx2-3P97334 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nkx2-3P97334 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nkx2-3P97334 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nkx2-3P97334 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nkx2-3P97334 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nkx2-3P97334 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nkx2-3P97334 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nkx2-3P97334 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nkx2-3P97334 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nkx2-3P97334 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nkx2-3P97334 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nkx2-3P97334 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Nkx2-3P97334 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nkx2-3P97334 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nkx2-3P97334 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nkx2-3P97334 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nkx2-3P97334 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nkx2-3P97334 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nkx2-3P97334 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nkx2-3P97334 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Nkx2-3P97334 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nkx2-3P97334 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nkx2-3P97334 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nkx2-3P97334 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nkx2-3P97334 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nkx2-3P97334 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nkx2-3P97334 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nkx2-3P97334 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nkx2-3P97334 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nkx2-3P97334 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nkx2-3P97334 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nkx2-3P97334 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nkx2-3P97334 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nkx2-3P97334 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nkx2-3P97334 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nkx2-3P97334 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nkx2-3P97334 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nkx2-3P97334 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nkx2-3P97334 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Nkx2-3P97334 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nkx2-3P97334 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nkx2-3P97334 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nkx2-3P97334 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nkx2-3P97334 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nkx2-3P97334 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nkx2-3P97334 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nkx2-3P97334 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nkx2-3P97334 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nkx2-3P97334 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nkx2-3P97334 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nkx2-3P97334 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Nkx2-3P97334 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nkx2-3P97334 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nkx2-3P97334 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nkx2-3P97334 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nkx2-3P97334 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nkx2-3P97334 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nkx2-3P97334 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Nkx2-3P97334 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nkx2-3P97334 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Nkx2-3P97334 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Nkx2-3P97334 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Nkx2-3P97334 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Nkx2-3P97334 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nkx2-3P97334 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nkx2-3P97334 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nkx2-3P97334 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nkx2-3P97334 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nkx2-3P97334 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nkx2-3P97334 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Nkx2-3P97334 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Nkx2-3P97334 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Nkx2-3P97334 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Nkx2-3P97334 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nkx2-3P97334 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nkx2-3P97334 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nkx2-3P97334 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nkx2-3P97334 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nkx2-3P97334 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nkx2-3P97334 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nkx2-3P97334 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nkx2-3P97334 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nkx2-3P97334 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nkx2-3P97334 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nkx2-3P97334 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nkx2-3P97334 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nkx2-3P97334 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nkx2-3P97334 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nkx2-3P97334 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nkx2-3P97334 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nkx2-3P97334 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nkx2-3P97334 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms