Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arf1P84078 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arf1P84078 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arf1P84078 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arf1P84078 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arf1P84078 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arf1P84078 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Arf1P84078 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Arf1P84078 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Arf1P84078 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Arf1P84078 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Arf1P84078 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Arf1P84078 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arf1P84078 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arf1P84078 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arf1P84078 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arf1P84078 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arf1P84078 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arf1P84078 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arf1P84078 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arf1P84078 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arf1P84078 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arf1P84078 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arf1P84078 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Arf1P84078 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Arf1P84078 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arf1P84078 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arf1P84078 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Arf1P84078 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arf1P84078 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Arf1P84078 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms