Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubg1P83887 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms