Protein–RNA interactions for Protein: P81117

Nucb2, Nucleobindin-2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb2P81117 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nucb2P81117 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nucb2P81117 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nucb2P81117 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nucb2P81117 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nucb2P81117 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nucb2P81117 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Nucb2P81117 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nucb2P81117 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nucb2P81117 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nucb2P81117 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nucb2P81117 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nucb2P81117 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nucb2P81117 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nucb2P81117 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nucb2P81117 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nucb2P81117 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nucb2P81117 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nucb2P81117 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nucb2P81117 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nucb2P81117 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nucb2P81117 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nucb2P81117 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nucb2P81117 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nucb2P81117 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nucb2P81117 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nucb2P81117 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nucb2P81117 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nucb2P81117 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nucb2P81117 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nucb2P81117 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nucb2P81117 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nucb2P81117 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Nucb2P81117 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nucb2P81117 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nucb2P81117 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nucb2P81117 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nucb2P81117 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nucb2P81117 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nucb2P81117 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nucb2P81117 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nucb2P81117 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nucb2P81117 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nucb2P81117 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nucb2P81117 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nucb2P81117 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nucb2P81117 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nucb2P81117 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nucb2P81117 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nucb2P81117 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Nucb2P81117 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Nucb2P81117 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nucb2P81117 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nucb2P81117 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nucb2P81117 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nucb2P81117 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nucb2P81117 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nucb2P81117 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nucb2P81117 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nucb2P81117 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nucb2P81117 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nucb2P81117 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nucb2P81117 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nucb2P81117 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nucb2P81117 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nucb2P81117 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nucb2P81117 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nucb2P81117 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nucb2P81117 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nucb2P81117 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nucb2P81117 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nucb2P81117 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nucb2P81117 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nucb2P81117 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nucb2P81117 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nucb2P81117 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nucb2P81117 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nucb2P81117 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nucb2P81117 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nucb2P81117 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nucb2P81117 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nucb2P81117 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nucb2P81117 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nucb2P81117 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nucb2P81117 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nucb2P81117 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nucb2P81117 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nucb2P81117 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nucb2P81117 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Nucb2P81117 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nucb2P81117 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nucb2P81117 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nucb2P81117 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nucb2P81117 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nucb2P81117 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nucb2P81117 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nucb2P81117 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nucb2P81117 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nucb2P81117 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nucb2P81117 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms