Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Irx2P81066 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Irx2P81066 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Irx2P81066 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Irx2P81066 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx2P81066 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx2P81066 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx2P81066 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx2P81066 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx2P81066 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx2P81066 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx2P81066 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx2P81066 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx2P81066 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx2P81066 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx2P81066 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx2P81066 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx2P81066 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx2P81066 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx2P81066 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx2P81066 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx2P81066 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx2P81066 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx2P81066 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx2P81066 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx2P81066 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx2P81066 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Irx2P81066 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Irx2P81066 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Irx2P81066 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Irx2P81066 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Irx2P81066 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Irx2P81066 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Irx2P81066 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irx2P81066 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irx2P81066 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irx2P81066 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irx2P81066 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irx2P81066 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx2P81066 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx2P81066 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx2P81066 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx2P81066 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx2P81066 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx2P81066 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx2P81066 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx2P81066 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx2P81066 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx2P81066 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx2P81066 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx2P81066 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx2P81066 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx2P81066 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx2P81066 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx2P81066 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx2P81066 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx2P81066 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx2P81066 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx2P81066 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx2P81066 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx2P81066 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx2P81066 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Irx2P81066 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Irx2P81066 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Irx2P81066 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Irx2P81066 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Irx2P81066 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Irx2P81066 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Irx2P81066 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Irx2P81066 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Irx2P81066 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Irx2P81066 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Irx2P81066 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Irx2P81066 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Irx2P81066 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Irx2P81066 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Irx2P81066 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Irx2P81066 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Irx2P81066 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Irx2P81066 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Irx2P81066 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Irx2P81066 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Irx2P81066 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Irx2P81066 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Irx2P81066 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Irx2P81066 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Irx2P81066 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Irx2P81066 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Irx2P81066 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Irx2P81066 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Irx2P81066 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Irx2P81066 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Irx2P81066 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Irx2P81066 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Irx2P81066 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Irx2P81066 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Irx2P81066 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Irx2P81066 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Irx2P81066 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Irx2P81066 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms