Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otx2P80206 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otx2P80206 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Otx2P80206 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Otx2P80206 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Otx2P80206 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Otx2P80206 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Otx2P80206 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Otx2P80206 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Otx2P80206 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Otx2P80206 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms