Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CiitaP79621 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CiitaP79621 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CiitaP79621 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CiitaP79621 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CiitaP79621 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CiitaP79621 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CiitaP79621 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CiitaP79621 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CiitaP79621 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CiitaP79621 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CiitaP79621 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CiitaP79621 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CiitaP79621 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CiitaP79621 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CiitaP79621 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CiitaP79621 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CiitaP79621 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CiitaP79621 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CiitaP79621 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CiitaP79621 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CiitaP79621 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CiitaP79621 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CiitaP79621 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CiitaP79621 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CiitaP79621 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CiitaP79621 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CiitaP79621 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CiitaP79621 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CiitaP79621 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CiitaP79621 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CiitaP79621 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CiitaP79621 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CiitaP79621 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CiitaP79621 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CiitaP79621 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CiitaP79621 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CiitaP79621 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CiitaP79621 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CiitaP79621 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CiitaP79621 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CiitaP79621 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CiitaP79621 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CiitaP79621 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CiitaP79621 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CiitaP79621 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CiitaP79621 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CiitaP79621 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CiitaP79621 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CiitaP79621 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CiitaP79621 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CiitaP79621 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CiitaP79621 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CiitaP79621 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CiitaP79621 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CiitaP79621 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CiitaP79621 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CiitaP79621 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CiitaP79621 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CiitaP79621 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CiitaP79621 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CiitaP79621 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CiitaP79621 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CiitaP79621 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CiitaP79621 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CiitaP79621 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CiitaP79621 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CiitaP79621 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CiitaP79621 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CiitaP79621 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CiitaP79621 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CiitaP79621 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CiitaP79621 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CiitaP79621 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CiitaP79621 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CiitaP79621 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CiitaP79621 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CiitaP79621 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CiitaP79621 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CiitaP79621 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CiitaP79621 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CiitaP79621 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CiitaP79621 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CiitaP79621 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CiitaP79621 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CiitaP79621 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CiitaP79621 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CiitaP79621 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CiitaP79621 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CiitaP79621 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CiitaP79621 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CiitaP79621 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CiitaP79621 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CiitaP79621 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CiitaP79621 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CiitaP79621 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CiitaP79621 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CiitaP79621 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms