Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rad50P70388 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rad50P70388 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rad50P70388 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rad50P70388 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rad50P70388 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rad50P70388 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rad50P70388 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Rad50P70388 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rad50P70388 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Rad50P70388 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rad50P70388 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rad50P70388 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rad50P70388 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rad50P70388 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rad50P70388 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rad50P70388 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Rad50P70388 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rad50P70388 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rad50P70388 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rad50P70388 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rad50P70388 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rad50P70388 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rad50P70388 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rad50P70388 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rad50P70388 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rad50P70388 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rad50P70388 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Rad50P70388 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rad50P70388 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rad50P70388 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rad50P70388 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rad50P70388 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rad50P70388 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rad50P70388 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Rad50P70388 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rad50P70388 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rad50P70388 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rad50P70388 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rad50P70388 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rad50P70388 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rad50P70388 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rad50P70388 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rad50P70388 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rad50P70388 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rad50P70388 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rad50P70388 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rad50P70388 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rad50P70388 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rad50P70388 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rad50P70388 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rad50P70388 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rad50P70388 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rad50P70388 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rad50P70388 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rad50P70388 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rad50P70388 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rad50P70388 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rad50P70388 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rad50P70388 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rad50P70388 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rad50P70388 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rad50P70388 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rad50P70388 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rad50P70388 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rad50P70388 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rad50P70388 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rad50P70388 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rad50P70388 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rad50P70388 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rad50P70388 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rad50P70388 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rad50P70388 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rad50P70388 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rad50P70388 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rad50P70388 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rad50P70388 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rad50P70388 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rad50P70388 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rad50P70388 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rad50P70388 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rad50P70388 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rad50P70388 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rad50P70388 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rad50P70388 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rad50P70388 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rad50P70388 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rad50P70388 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rad50P70388 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rad50P70388 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rad50P70388 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rad50P70388 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rad50P70388 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rad50P70388 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rad50P70388 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rad50P70388 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rad50P70388 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rad50P70388 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rad50P70388 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rad50P70388 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms