Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SeboxP70368 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SeboxP70368 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SeboxP70368 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SeboxP70368 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SeboxP70368 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SeboxP70368 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SeboxP70368 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SeboxP70368 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SeboxP70368 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SeboxP70368 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SeboxP70368 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SeboxP70368 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SeboxP70368 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms