Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ufd1P70362 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ufd1P70362 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms