Protein–RNA interactions for Protein: P70295

Aup1, Ancient ubiquitous protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aup1P70295 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Aup1P70295 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Aup1P70295 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Aup1P70295 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Aup1P70295 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Aup1P70295 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Aup1P70295 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Aup1P70295 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Aup1P70295 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Aup1P70295 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Aup1P70295 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Aup1P70295 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Aup1P70295 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Aup1P70295 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Aup1P70295 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Aup1P70295 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Aup1P70295 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Aup1P70295 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Aup1P70295 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Aup1P70295 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Aup1P70295 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Aup1P70295 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Aup1P70295 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Aup1P70295 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Aup1P70295 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Aup1P70295 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Aup1P70295 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Aup1P70295 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Aup1P70295 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Aup1P70295 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Aup1P70295 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Aup1P70295 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Aup1P70295 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Aup1P70295 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Aup1P70295 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Aup1P70295 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Aup1P70295 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Aup1P70295 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Aup1P70295 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Aup1P70295 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Aup1P70295 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Aup1P70295 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Aup1P70295 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Aup1P70295 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Aup1P70295 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Aup1P70295 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Aup1P70295 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Aup1P70295 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Aup1P70295 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Aup1P70295 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Aup1P70295 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Aup1P70295 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Aup1P70295 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Aup1P70295 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aup1P70295 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Aup1P70295 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Aup1P70295 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Aup1P70295 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aup1P70295 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aup1P70295 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms