Protein–RNA interactions for Protein: P70248

Myo1f, Unconventional myosin-If, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1fP70248 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Myo1fP70248 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Myo1fP70248 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Myo1fP70248 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Myo1fP70248 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Myo1fP70248 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Myo1fP70248 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Myo1fP70248 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Myo1fP70248 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Myo1fP70248 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Myo1fP70248 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Myo1fP70248 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Myo1fP70248 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Myo1fP70248 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Myo1fP70248 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Myo1fP70248 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Myo1fP70248 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Myo1fP70248 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Myo1fP70248 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Myo1fP70248 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Myo1fP70248 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Myo1fP70248 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Myo1fP70248 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Myo1fP70248 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Myo1fP70248 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Myo1fP70248 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Myo1fP70248 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Myo1fP70248 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Myo1fP70248 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Myo1fP70248 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Myo1fP70248 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Myo1fP70248 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Myo1fP70248 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Myo1fP70248 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Myo1fP70248 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Myo1fP70248 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Myo1fP70248 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Myo1fP70248 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Myo1fP70248 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Myo1fP70248 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Myo1fP70248 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Myo1fP70248 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Myo1fP70248 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Myo1fP70248 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Myo1fP70248 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Myo1fP70248 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Myo1fP70248 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Myo1fP70248 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Myo1fP70248 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Myo1fP70248 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Myo1fP70248 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Myo1fP70248 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Myo1fP70248 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Myo1fP70248 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Myo1fP70248 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Myo1fP70248 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Myo1fP70248 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Myo1fP70248 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Myo1fP70248 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Myo1fP70248 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Myo1fP70248 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Myo1fP70248 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Myo1fP70248 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Myo1fP70248 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Myo1fP70248 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Myo1fP70248 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Myo1fP70248 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Myo1fP70248 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Myo1fP70248 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Myo1fP70248 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Myo1fP70248 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Myo1fP70248 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Myo1fP70248 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Myo1fP70248 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Myo1fP70248 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Myo1fP70248 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Myo1fP70248 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Myo1fP70248 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Myo1fP70248 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Myo1fP70248 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Myo1fP70248 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Myo1fP70248 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Myo1fP70248 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Myo1fP70248 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Myo1fP70248 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Myo1fP70248 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Myo1fP70248 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Myo1fP70248 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Myo1fP70248 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Myo1fP70248 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Myo1fP70248 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Myo1fP70248 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Myo1fP70248 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Myo1fP70248 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Myo1fP70248 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Myo1fP70248 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Myo1fP70248 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Myo1fP70248 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Myo1fP70248 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Myo1fP70248 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms