Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Traf6P70196 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Traf6P70196 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf6P70196 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Traf6P70196 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Traf6P70196 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Traf6P70196 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Traf6P70196 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Traf6P70196 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Traf6P70196 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Traf6P70196 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Traf6P70196 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf6P70196 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf6P70196 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf6P70196 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf6P70196 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf6P70196 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf6P70196 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf6P70196 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf6P70196 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms