Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Traf5P70191 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Traf5P70191 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Traf5P70191 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Traf5P70191 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Traf5P70191 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Traf5P70191 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Traf5P70191 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Traf5P70191 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Traf5P70191 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Traf5P70191 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Traf5P70191 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Traf5P70191 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Traf5P70191 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Traf5P70191 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Traf5P70191 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Traf5P70191 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Traf5P70191 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Traf5P70191 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Traf5P70191 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Traf5P70191 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Traf5P70191 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Traf5P70191 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Traf5P70191 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Traf5P70191 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Traf5P70191 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Traf5P70191 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Traf5P70191 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Traf5P70191 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Traf5P70191 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Traf5P70191 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Traf5P70191 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Traf5P70191 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Traf5P70191 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Traf5P70191 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Traf5P70191 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Traf5P70191 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Traf5P70191 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Traf5P70191 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Traf5P70191 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Traf5P70191 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Traf5P70191 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Traf5P70191 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Traf5P70191 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Traf5P70191 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Traf5P70191 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Traf5P70191 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Traf5P70191 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Traf5P70191 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Traf5P70191 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Traf5P70191 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Traf5P70191 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Traf5P70191 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Traf5P70191 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Traf5P70191 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Traf5P70191 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Traf5P70191 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Traf5P70191 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Traf5P70191 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Traf5P70191 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Traf5P70191 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Traf5P70191 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Traf5P70191 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Traf5P70191 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Traf5P70191 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Traf5P70191 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Traf5P70191 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Traf5P70191 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Traf5P70191 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Traf5P70191 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Traf5P70191 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Traf5P70191 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Traf5P70191 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Traf5P70191 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Traf5P70191 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Traf5P70191 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Traf5P70191 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Traf5P70191 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Traf5P70191 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Traf5P70191 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Traf5P70191 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Traf5P70191 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Traf5P70191 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Traf5P70191 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Traf5P70191 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Traf5P70191 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Traf5P70191 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Traf5P70191 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Traf5P70191 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Traf5P70191 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Traf5P70191 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Traf5P70191 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Traf5P70191 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Traf5P70191 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Traf5P70191 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Traf5P70191 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Traf5P70191 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Traf5P70191 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Traf5P70191 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Traf5P70191 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms