Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SbdsP70122 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SbdsP70122 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SbdsP70122 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SbdsP70122 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SbdsP70122 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SbdsP70122 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SbdsP70122 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SbdsP70122 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SbdsP70122 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SbdsP70122 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SbdsP70122 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SbdsP70122 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SbdsP70122 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SbdsP70122 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SbdsP70122 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SbdsP70122 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SbdsP70122 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SbdsP70122 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SbdsP70122 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SbdsP70122 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SbdsP70122 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SbdsP70122 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SbdsP70122 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SbdsP70122 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SbdsP70122 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SbdsP70122 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SbdsP70122 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SbdsP70122 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SbdsP70122 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SbdsP70122 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SbdsP70122 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SbdsP70122 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SbdsP70122 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SbdsP70122 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SbdsP70122 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SbdsP70122 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SbdsP70122 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SbdsP70122 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SbdsP70122 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SbdsP70122 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SbdsP70122 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SbdsP70122 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SbdsP70122 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SbdsP70122 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SbdsP70122 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SbdsP70122 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SbdsP70122 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SbdsP70122 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SbdsP70122 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SbdsP70122 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SbdsP70122 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SbdsP70122 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SbdsP70122 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SbdsP70122 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SbdsP70122 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SbdsP70122 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SbdsP70122 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SbdsP70122 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SbdsP70122 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SbdsP70122 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SbdsP70122 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SbdsP70122 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SbdsP70122 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SbdsP70122 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SbdsP70122 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SbdsP70122 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SbdsP70122 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SbdsP70122 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SbdsP70122 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SbdsP70122 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SbdsP70122 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SbdsP70122 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SbdsP70122 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SbdsP70122 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SbdsP70122 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SbdsP70122 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SbdsP70122 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SbdsP70122 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SbdsP70122 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SbdsP70122 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SbdsP70122 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SbdsP70122 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SbdsP70122 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SbdsP70122 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SbdsP70122 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SbdsP70122 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms