Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms