Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrkcbP68404 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrkcbP68404 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms