Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tubb4bP68372 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tubb4bP68372 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Tubb4bP68372 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tubb4bP68372 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms