Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp3P63024 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp3P63024 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms