Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps3P62908 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps3P62908 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps3P62908 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps3P62908 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rps3P62908 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rps3P62908 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rps3P62908 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rps3P62908 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rps3P62908 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rps3P62908 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rps3P62908 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rps3P62908 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rps3P62908 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rps3P62908 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rps3P62908 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rps3P62908 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rps3P62908 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rps3P62908 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rps3P62908 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rps3P62908 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rps3P62908 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rps3P62908 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rps3P62908 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rps3P62908 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rps3P62908 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rps3P62908 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rps3P62908 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rps3P62908 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rps3P62908 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rps3P62908 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rps3P62908 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rps3P62908 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rps3P62908 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rps3P62908 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rps3P62908 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rps3P62908 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rps3P62908 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rps3P62908 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rps3P62908 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rps3P62908 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rps3P62908 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rps3P62908 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rps3P62908 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rps3P62908 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps3P62908 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps3P62908 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps3P62908 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps3P62908 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps3P62908 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps3P62908 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps3P62908 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps3P62908 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps3P62908 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps3P62908 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps3P62908 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps3P62908 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps3P62908 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps3P62908 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps3P62908 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps3P62908 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps3P62908 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps3P62908 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps3P62908 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps3P62908 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps3P62908 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps3P62908 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps3P62908 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps3P62908 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps3P62908 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps3P62908 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps3P62908 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps3P62908 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps3P62908 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps3P62908 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps3P62908 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps3P62908 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps3P62908 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps3P62908 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps3P62908 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps3P62908 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps3P62908 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps3P62908 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps3P62908 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps3P62908 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps3P62908 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps3P62908 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps3P62908 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps3P62908 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps3P62908 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps3P62908 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps3P62908 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps3P62908 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps3P62908 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps3P62908 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps3P62908 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps3P62908 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps3P62908 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps3P62908 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps3P62908 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms