Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gabra1P62812 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms