Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vsnl1P62761 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vsnl1P62761 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vsnl1P62761 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vsnl1P62761 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vsnl1P62761 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vsnl1P62761 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vsnl1P62761 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vsnl1P62761 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vsnl1P62761 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vsnl1P62761 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vsnl1P62761 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vsnl1P62761 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vsnl1P62761 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vsnl1P62761 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vsnl1P62761 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vsnl1P62761 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vsnl1P62761 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Vsnl1P62761 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vsnl1P62761 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vsnl1P62761 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vsnl1P62761 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vsnl1P62761 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vsnl1P62761 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vsnl1P62761 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vsnl1P62761 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vsnl1P62761 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vsnl1P62761 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vsnl1P62761 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vsnl1P62761 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Vsnl1P62761 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vsnl1P62761 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vsnl1P62761 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vsnl1P62761 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vsnl1P62761 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vsnl1P62761 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vsnl1P62761 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vsnl1P62761 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vsnl1P62761 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vsnl1P62761 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vsnl1P62761 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vsnl1P62761 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vsnl1P62761 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vsnl1P62761 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vsnl1P62761 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vsnl1P62761 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vsnl1P62761 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vsnl1P62761 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vsnl1P62761 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vsnl1P62761 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vsnl1P62761 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vsnl1P62761 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vsnl1P62761 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vsnl1P62761 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vsnl1P62761 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vsnl1P62761 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vsnl1P62761 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vsnl1P62761 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vsnl1P62761 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vsnl1P62761 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vsnl1P62761 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vsnl1P62761 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vsnl1P62761 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vsnl1P62761 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vsnl1P62761 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vsnl1P62761 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vsnl1P62761 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vsnl1P62761 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vsnl1P62761 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vsnl1P62761 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vsnl1P62761 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vsnl1P62761 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vsnl1P62761 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vsnl1P62761 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vsnl1P62761 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vsnl1P62761 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vsnl1P62761 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vsnl1P62761 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vsnl1P62761 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vsnl1P62761 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vsnl1P62761 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vsnl1P62761 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vsnl1P62761 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vsnl1P62761 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vsnl1P62761 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vsnl1P62761 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vsnl1P62761 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Vsnl1P62761 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vsnl1P62761 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vsnl1P62761 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vsnl1P62761 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vsnl1P62761 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vsnl1P62761 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vsnl1P62761 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vsnl1P62761 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Vsnl1P62761 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vsnl1P62761 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vsnl1P62761 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vsnl1P62761 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Vsnl1P62761 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms