Protein–RNA interactions for Protein: P62492

Rab11a, Ras-related protein Rab-11A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11aP62492 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rab11aP62492 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11aP62492 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms