Protein–RNA interactions for Protein: P62334

Psmc6, 26S proteasome regulatory subunit 10B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc6P62334 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmc6P62334 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmc6P62334 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmc6P62334 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmc6P62334 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmc6P62334 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmc6P62334 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmc6P62334 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmc6P62334 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmc6P62334 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmc6P62334 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmc6P62334 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmc6P62334 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmc6P62334 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmc6P62334 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmc6P62334 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmc6P62334 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmc6P62334 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmc6P62334 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmc6P62334 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmc6P62334 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmc6P62334 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmc6P62334 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmc6P62334 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmc6P62334 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmc6P62334 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmc6P62334 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmc6P62334 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmc6P62334 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmc6P62334 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmc6P62334 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmc6P62334 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmc6P62334 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmc6P62334 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmc6P62334 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmc6P62334 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmc6P62334 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmc6P62334 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmc6P62334 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmc6P62334 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmc6P62334 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmc6P62334 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmc6P62334 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmc6P62334 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmc6P62334 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmc6P62334 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmc6P62334 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmc6P62334 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmc6P62334 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmc6P62334 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmc6P62334 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmc6P62334 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmc6P62334 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmc6P62334 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmc6P62334 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmc6P62334 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmc6P62334 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmc6P62334 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmc6P62334 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmc6P62334 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmc6P62334 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmc6P62334 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmc6P62334 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmc6P62334 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmc6P62334 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmc6P62334 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmc6P62334 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmc6P62334 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmc6P62334 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmc6P62334 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmc6P62334 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmc6P62334 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Psmc6P62334 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Psmc6P62334 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Psmc6P62334 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Psmc6P62334 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmc6P62334 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmc6P62334 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmc6P62334 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmc6P62334 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmc6P62334 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmc6P62334 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmc6P62334 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmc6P62334 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmc6P62334 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmc6P62334 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmc6P62334 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmc6P62334 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmc6P62334 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmc6P62334 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmc6P62334 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmc6P62334 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmc6P62334 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmc6P62334 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmc6P62334 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmc6P62334 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmc6P62334 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmc6P62334 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmc6P62334 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmc6P62334 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms