Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpd3P62320 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms