Protein–RNA interactions for Protein: P62305

Snrpe, Small nuclear ribonucleoprotein E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpeP62305 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms