Protein–RNA interactions for Protein: P62270

Rps18, 40S ribosomal protein S18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps18P62270 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rps18P62270 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rps18P62270 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rps18P62270 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rps18P62270 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rps18P62270 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rps18P62270 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rps18P62270 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rps18P62270 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rps18P62270 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rps18P62270 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rps18P62270 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rps18P62270 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rps18P62270 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rps18P62270 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rps18P62270 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rps18P62270 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps18P62270 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps18P62270 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps18P62270 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps18P62270 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps18P62270 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps18P62270 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps18P62270 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps18P62270 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps18P62270 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps18P62270 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps18P62270 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps18P62270 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps18P62270 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps18P62270 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps18P62270 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rps18P62270 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps18P62270 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps18P62270 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps18P62270 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps18P62270 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps18P62270 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms