Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr2fP61219 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr2fP61219 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr2fP61219 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr2fP61219 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr2fP61219 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr2fP61219 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr2fP61219 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr2fP61219 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr2fP61219 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr2fP61219 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr2fP61219 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr2fP61219 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr2fP61219 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Polr2fP61219 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Polr2fP61219 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Polr2fP61219 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Polr2fP61219 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Polr2fP61219 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Polr2fP61219 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Polr2fP61219 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Polr2fP61219 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Polr2fP61219 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Polr2fP61219 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Polr2fP61219 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Polr2fP61219 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Polr2fP61219 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Polr2fP61219 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Polr2fP61219 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Polr2fP61219 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Polr2fP61219 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Polr2fP61219 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Polr2fP61219 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr2fP61219 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr2fP61219 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr2fP61219 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr2fP61219 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr2fP61219 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr2fP61219 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr2fP61219 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr2fP61219 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr2fP61219 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr2fP61219 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr2fP61219 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Polr2fP61219 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Polr2fP61219 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Polr2fP61219 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Polr2fP61219 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Polr2fP61219 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Polr2fP61219 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Polr2fP61219 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Polr2fP61219 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Polr2fP61219 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Polr2fP61219 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Polr2fP61219 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Polr2fP61219 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Polr2fP61219 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Polr2fP61219 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Polr2fP61219 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Polr2fP61219 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Polr2fP61219 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Polr2fP61219 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Polr2fP61219 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Polr2fP61219 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Polr2fP61219 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Polr2fP61219 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Polr2fP61219 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Polr2fP61219 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Polr2fP61219 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Polr2fP61219 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Polr2fP61219 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Polr2fP61219 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Polr2fP61219 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Polr2fP61219 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Polr2fP61219 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Polr2fP61219 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Polr2fP61219 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Polr2fP61219 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Polr2fP61219 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Polr2fP61219 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Polr2fP61219 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Polr2fP61219 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Polr2fP61219 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Polr2fP61219 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Polr2fP61219 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Polr2fP61219 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Polr2fP61219 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Polr2fP61219 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Polr2fP61219 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Polr2fP61219 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Polr2fP61219 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Polr2fP61219 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Polr2fP61219 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Polr2fP61219 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Polr2fP61219 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Polr2fP61219 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Polr2fP61219 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Polr2fP61219 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Polr2fP61219 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Polr2fP61219 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms