Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppfia3P60469 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppfia3P60469 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppfia3P60469 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppfia3P60469 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppfia3P60469 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppfia3P60469 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppfia3P60469 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppfia3P60469 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppfia3P60469 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppfia3P60469 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppfia3P60469 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppfia3P60469 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppfia3P60469 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppfia3P60469 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppfia3P60469 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ppfia3P60469 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppfia3P60469 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppfia3P60469 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppfia3P60469 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppfia3P60469 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppfia3P60469 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppfia3P60469 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppfia3P60469 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppfia3P60469 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppfia3P60469 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppfia3P60469 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppfia3P60469 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppfia3P60469 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppfia3P60469 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppfia3P60469 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppfia3P60469 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppfia3P60469 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppfia3P60469 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppfia3P60469 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppfia3P60469 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppfia3P60469 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppfia3P60469 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppfia3P60469 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppfia3P60469 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppfia3P60469 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppfia3P60469 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppfia3P60469 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppfia3P60469 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppfia3P60469 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppfia3P60469 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppfia3P60469 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppfia3P60469 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppfia3P60469 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppfia3P60469 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppfia3P60469 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppfia3P60469 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppfia3P60469 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppfia3P60469 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppfia3P60469 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppfia3P60469 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppfia3P60469 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppfia3P60469 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppfia3P60469 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppfia3P60469 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppfia3P60469 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppfia3P60469 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppfia3P60469 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppfia3P60469 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppfia3P60469 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppfia3P60469 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppfia3P60469 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppfia3P60469 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppfia3P60469 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppfia3P60469 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppfia3P60469 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppfia3P60469 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppfia3P60469 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppfia3P60469 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppfia3P60469 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppfia3P60469 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppfia3P60469 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppfia3P60469 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppfia3P60469 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppfia3P60469 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppfia3P60469 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppfia3P60469 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppfia3P60469 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppfia3P60469 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppfia3P60469 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppfia3P60469 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppfia3P60469 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppfia3P60469 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppfia3P60469 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppfia3P60469 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppfia3P60469 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppfia3P60469 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppfia3P60469 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppfia3P60469 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppfia3P60469 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppfia3P60469 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppfia3P60469 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms