Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Eif3eP60229 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Eif3eP60229 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Eif3eP60229 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Eif3eP60229 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Eif3eP60229 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Eif3eP60229 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Eif3eP60229 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Eif3eP60229 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Eif3eP60229 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Eif3eP60229 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Eif3eP60229 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Eif3eP60229 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Eif3eP60229 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Eif3eP60229 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eif3eP60229 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eif3eP60229 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eif3eP60229 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eif3eP60229 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eif3eP60229 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eif3eP60229 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eif3eP60229 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eif3eP60229 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eif3eP60229 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eif3eP60229 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eif3eP60229 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eif3eP60229 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Eif3eP60229 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Eif3eP60229 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Eif3eP60229 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Eif3eP60229 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Eif3eP60229 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Eif3eP60229 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Eif3eP60229 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Eif3eP60229 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Eif3eP60229 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eif3eP60229 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eif3eP60229 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eif3eP60229 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eif3eP60229 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eif3eP60229 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eif3eP60229 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eif3eP60229 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Eif3eP60229 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Eif3eP60229 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Eif3eP60229 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Eif3eP60229 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Eif3eP60229 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Eif3eP60229 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Eif3eP60229 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Eif3eP60229 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Eif3eP60229 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Eif3eP60229 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Eif3eP60229 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Eif3eP60229 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Eif3eP60229 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Eif3eP60229 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Eif3eP60229 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Eif3eP60229 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Eif3eP60229 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Eif3eP60229 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Eif3eP60229 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Eif3eP60229 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Eif3eP60229 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Eif3eP60229 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Eif3eP60229 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Eif3eP60229 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Eif3eP60229 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Eif3eP60229 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Eif3eP60229 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Eif3eP60229 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Eif3eP60229 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Eif3eP60229 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Eif3eP60229 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Eif3eP60229 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eif3eP60229 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eif3eP60229 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eif3eP60229 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eif3eP60229 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eif3eP60229 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eif3eP60229 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eif3eP60229 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eif3eP60229 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Eif3eP60229 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Eif3eP60229 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms