Protein–RNA interactions for Protein: P59114

Pcif1, Phosphorylated CTD-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcif1P59114 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcif1P59114 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcif1P59114 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcif1P59114 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcif1P59114 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcif1P59114 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcif1P59114 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcif1P59114 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcif1P59114 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcif1P59114 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcif1P59114 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcif1P59114 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcif1P59114 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcif1P59114 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcif1P59114 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcif1P59114 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcif1P59114 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcif1P59114 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcif1P59114 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcif1P59114 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcif1P59114 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcif1P59114 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcif1P59114 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcif1P59114 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcif1P59114 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcif1P59114 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcif1P59114 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcif1P59114 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcif1P59114 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcif1P59114 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcif1P59114 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcif1P59114 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcif1P59114 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcif1P59114 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcif1P59114 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcif1P59114 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcif1P59114 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcif1P59114 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcif1P59114 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcif1P59114 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcif1P59114 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcif1P59114 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcif1P59114 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcif1P59114 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcif1P59114 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcif1P59114 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcif1P59114 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcif1P59114 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcif1P59114 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcif1P59114 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcif1P59114 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcif1P59114 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcif1P59114 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcif1P59114 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcif1P59114 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcif1P59114 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcif1P59114 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcif1P59114 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcif1P59114 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcif1P59114 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcif1P59114 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcif1P59114 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcif1P59114 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcif1P59114 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcif1P59114 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcif1P59114 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcif1P59114 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcif1P59114 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcif1P59114 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcif1P59114 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcif1P59114 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcif1P59114 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcif1P59114 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcif1P59114 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcif1P59114 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcif1P59114 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcif1P59114 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcif1P59114 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcif1P59114 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcif1P59114 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcif1P59114 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcif1P59114 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcif1P59114 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcif1P59114 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcif1P59114 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcif1P59114 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcif1P59114 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcif1P59114 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcif1P59114 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcif1P59114 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcif1P59114 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcif1P59114 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcif1P59114 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcif1P59114 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcif1P59114 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcif1P59114 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcif1P59114 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcif1P59114 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcif1P59114 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcif1P59114 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms