Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vps33bP59016 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vps33bP59016 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vps33bP59016 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Vps33bP59016 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Vps33bP59016 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Vps33bP59016 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Vps33bP59016 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vps33bP59016 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vps33bP59016 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vps33bP59016 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Vps33bP59016 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vps33bP59016 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Vps33bP59016 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vps33bP59016 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vps33bP59016 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vps33bP59016 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vps33bP59016 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vps33bP59016 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vps33bP59016 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vps33bP59016 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vps33bP59016 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vps33bP59016 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vps33bP59016 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vps33bP59016 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vps33bP59016 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vps33bP59016 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vps33bP59016 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Vps33bP59016 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Vps33bP59016 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Vps33bP59016 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Vps33bP59016 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Vps33bP59016 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Vps33bP59016 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vps33bP59016 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vps33bP59016 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vps33bP59016 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vps33bP59016 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vps33bP59016 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vps33bP59016 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vps33bP59016 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vps33bP59016 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vps33bP59016 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vps33bP59016 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vps33bP59016 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vps33bP59016 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vps33bP59016 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vps33bP59016 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vps33bP59016 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vps33bP59016 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vps33bP59016 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vps33bP59016 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vps33bP59016 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vps33bP59016 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vps33bP59016 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vps33bP59016 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vps33bP59016 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vps33bP59016 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vps33bP59016 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vps33bP59016 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vps33bP59016 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vps33bP59016 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vps33bP59016 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vps33bP59016 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vps33bP59016 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Vps33bP59016 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vps33bP59016 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vps33bP59016 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vps33bP59016 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vps33bP59016 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vps33bP59016 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Vps33bP59016 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Vps33bP59016 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Vps33bP59016 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Vps33bP59016 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Vps33bP59016 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Vps33bP59016 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Vps33bP59016 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Vps33bP59016 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Vps33bP59016 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Vps33bP59016 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Vps33bP59016 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Vps33bP59016 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Vps33bP59016 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Vps33bP59016 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Vps33bP59016 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vps33bP59016 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vps33bP59016 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vps33bP59016 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vps33bP59016 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vps33bP59016 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Vps33bP59016 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vps33bP59016 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Vps33bP59016 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Vps33bP59016 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Vps33bP59016 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Vps33bP59016 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Vps33bP59016 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Vps33bP59016 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Vps33bP59016 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms