Protein–RNA interactions for Protein: P58771

Tpm1, Tropomyosin alpha-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm1P58771 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpm1P58771 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpm1P58771 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpm1P58771 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpm1P58771 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpm1P58771 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpm1P58771 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpm1P58771 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpm1P58771 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpm1P58771 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpm1P58771 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpm1P58771 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpm1P58771 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpm1P58771 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpm1P58771 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpm1P58771 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpm1P58771 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpm1P58771 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpm1P58771 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpm1P58771 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpm1P58771 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tpm1P58771 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tpm1P58771 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tpm1P58771 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tpm1P58771 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tpm1P58771 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tpm1P58771 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpm1P58771 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpm1P58771 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpm1P58771 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpm1P58771 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpm1P58771 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpm1P58771 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpm1P58771 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpm1P58771 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpm1P58771 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tpm1P58771 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tpm1P58771 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tpm1P58771 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tpm1P58771 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tpm1P58771 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tpm1P58771 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms