Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Strn4P58404 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Strn4P58404 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Strn4P58404 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Strn4P58404 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Strn4P58404 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Strn4P58404 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Strn4P58404 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Strn4P58404 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Strn4P58404 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Strn4P58404 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Strn4P58404 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Strn4P58404 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Strn4P58404 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Strn4P58404 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Strn4P58404 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Strn4P58404 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Strn4P58404 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Strn4P58404 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Strn4P58404 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Strn4P58404 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Strn4P58404 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Strn4P58404 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Strn4P58404 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Strn4P58404 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Strn4P58404 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Strn4P58404 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Strn4P58404 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Strn4P58404 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Strn4P58404 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Strn4P58404 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Strn4P58404 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Strn4P58404 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Strn4P58404 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Strn4P58404 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Strn4P58404 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Strn4P58404 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Strn4P58404 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Strn4P58404 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Strn4P58404 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Strn4P58404 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Strn4P58404 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Strn4P58404 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Strn4P58404 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Strn4P58404 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Strn4P58404 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Strn4P58404 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Strn4P58404 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Strn4P58404 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Strn4P58404 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Strn4P58404 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Strn4P58404 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Strn4P58404 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Strn4P58404 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Strn4P58404 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Strn4P58404 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Strn4P58404 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Strn4P58404 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Strn4P58404 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Strn4P58404 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Strn4P58404 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Strn4P58404 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Strn4P58404 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Strn4P58404 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Strn4P58404 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Strn4P58404 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Strn4P58404 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Strn4P58404 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Strn4P58404 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Strn4P58404 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Strn4P58404 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Strn4P58404 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Strn4P58404 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Strn4P58404 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Strn4P58404 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Strn4P58404 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Strn4P58404 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Strn4P58404 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Strn4P58404 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Strn4P58404 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Strn4P58404 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Strn4P58404 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Strn4P58404 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Strn4P58404 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Strn4P58404 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Strn4P58404 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Strn4P58404 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Strn4P58404 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Strn4P58404 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Strn4P58404 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Strn4P58404 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Strn4P58404 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Strn4P58404 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Strn4P58404 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Strn4P58404 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Strn4P58404 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Strn4P58404 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Strn4P58404 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Strn4P58404 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Strn4P58404 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms