Protein–RNA interactions for Protein: P58281

Opa1, Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa1P58281 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Opa1P58281 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Opa1P58281 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Opa1P58281 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Opa1P58281 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Opa1P58281 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Opa1P58281 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Opa1P58281 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Opa1P58281 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Opa1P58281 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Opa1P58281 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Opa1P58281 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Opa1P58281 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Opa1P58281 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Opa1P58281 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Opa1P58281 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Opa1P58281 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Opa1P58281 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Opa1P58281 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Opa1P58281 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Opa1P58281 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Opa1P58281 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Opa1P58281 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Opa1P58281 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Opa1P58281 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Opa1P58281 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Opa1P58281 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Opa1P58281 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Opa1P58281 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Opa1P58281 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Opa1P58281 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Opa1P58281 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Opa1P58281 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Opa1P58281 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Opa1P58281 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Opa1P58281 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Opa1P58281 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Opa1P58281 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Opa1P58281 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Opa1P58281 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Opa1P58281 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Opa1P58281 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Opa1P58281 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Opa1P58281 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Opa1P58281 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Opa1P58281 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Opa1P58281 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Opa1P58281 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Opa1P58281 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Opa1P58281 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Opa1P58281 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Opa1P58281 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Opa1P58281 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Opa1P58281 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Opa1P58281 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Opa1P58281 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Opa1P58281 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Opa1P58281 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Opa1P58281 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Opa1P58281 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Opa1P58281 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Opa1P58281 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Opa1P58281 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Opa1P58281 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Opa1P58281 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Opa1P58281 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Opa1P58281 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Opa1P58281 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Opa1P58281 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Opa1P58281 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Opa1P58281 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Opa1P58281 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Opa1P58281 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Opa1P58281 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Opa1P58281 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Opa1P58281 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Opa1P58281 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Opa1P58281 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Opa1P58281 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Opa1P58281 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Opa1P58281 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Opa1P58281 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Opa1P58281 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Opa1P58281 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Opa1P58281 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Opa1P58281 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Opa1P58281 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Opa1P58281 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Opa1P58281 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Opa1P58281 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Opa1P58281 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Opa1P58281 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Opa1P58281 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Opa1P58281 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Opa1P58281 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Opa1P58281 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Opa1P58281 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Opa1P58281 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Opa1P58281 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Opa1P58281 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms