Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CtnsP57757 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CtnsP57757 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CtnsP57757 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CtnsP57757 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CtnsP57757 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CtnsP57757 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CtnsP57757 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CtnsP57757 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CtnsP57757 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CtnsP57757 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CtnsP57757 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CtnsP57757 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CtnsP57757 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CtnsP57757 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CtnsP57757 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CtnsP57757 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CtnsP57757 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CtnsP57757 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CtnsP57757 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CtnsP57757 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CtnsP57757 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CtnsP57757 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CtnsP57757 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CtnsP57757 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CtnsP57757 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CtnsP57757 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CtnsP57757 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CtnsP57757 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CtnsP57757 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CtnsP57757 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CtnsP57757 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CtnsP57757 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CtnsP57757 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CtnsP57757 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CtnsP57757 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CtnsP57757 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CtnsP57757 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CtnsP57757 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CtnsP57757 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CtnsP57757 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CtnsP57757 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CtnsP57757 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CtnsP57757 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CtnsP57757 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms