Protein–RNA interactions for Protein: P56873

Sssca1, Sjoegren syndrome/scleroderma autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sssca1P56873 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sssca1P56873 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sssca1P56873 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms