Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn18P56857 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn18P56857 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn18P56857 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn18P56857 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn18P56857 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn18P56857 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn18P56857 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn18P56857 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn18P56857 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn18P56857 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn18P56857 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn18P56857 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn18P56857 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cldn18P56857 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cldn18P56857 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cldn18P56857 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cldn18P56857 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cldn18P56857 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn18P56857 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn18P56857 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn18P56857 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn18P56857 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn18P56857 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn18P56857 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn18P56857 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn18P56857 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn18P56857 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn18P56857 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn18P56857 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn18P56857 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn18P56857 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn18P56857 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn18P56857 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn18P56857 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn18P56857 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn18P56857 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn18P56857 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn18P56857 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn18P56857 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn18P56857 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn18P56857 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn18P56857 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn18P56857 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn18P56857 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn18P56857 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn18P56857 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn18P56857 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn18P56857 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn18P56857 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn18P56857 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn18P56857 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn18P56857 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn18P56857 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn18P56857 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn18P56857 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn18P56857 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn18P56857 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn18P56857 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn18P56857 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn18P56857 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn18P56857 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn18P56857 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn18P56857 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn18P56857 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn18P56857 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn18P56857 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn18P56857 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn18P56857 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn18P56857 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn18P56857 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn18P56857 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn18P56857 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn18P56857 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms