Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TdgP56581 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TdgP56581 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TdgP56581 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TdgP56581 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TdgP56581 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TdgP56581 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TdgP56581 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TdgP56581 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TdgP56581 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TdgP56581 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TdgP56581 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TdgP56581 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TdgP56581 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TdgP56581 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TdgP56581 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TdgP56581 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TdgP56581 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TdgP56581 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TdgP56581 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TdgP56581 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TdgP56581 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TdgP56581 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TdgP56581 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TdgP56581 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TdgP56581 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TdgP56581 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TdgP56581 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TdgP56581 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TdgP56581 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TdgP56581 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TdgP56581 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TdgP56581 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TdgP56581 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TdgP56581 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TdgP56581 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TdgP56581 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TdgP56581 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TdgP56581 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TdgP56581 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TdgP56581 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TdgP56581 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TdgP56581 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TdgP56581 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TdgP56581 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TdgP56581 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TdgP56581 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TdgP56581 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TdgP56581 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TdgP56581 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TdgP56581 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TdgP56581 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TdgP56581 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TdgP56581 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TdgP56581 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TdgP56581 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TdgP56581 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TdgP56581 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TdgP56581 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TdgP56581 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TdgP56581 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TdgP56581 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TdgP56581 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TdgP56581 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TdgP56581 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TdgP56581 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TdgP56581 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TdgP56581 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TdgP56581 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TdgP56581 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TdgP56581 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TdgP56581 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TdgP56581 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TdgP56581 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TdgP56581 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TdgP56581 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TdgP56581 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TdgP56581 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TdgP56581 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TdgP56581 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TdgP56581 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TdgP56581 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TdgP56581 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TdgP56581 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TdgP56581 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TdgP56581 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TdgP56581 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TdgP56581 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TdgP56581 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TdgP56581 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TdgP56581 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TdgP56581 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TdgP56581 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TdgP56581 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TdgP56581 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TdgP56581 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TdgP56581 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TdgP56581 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TdgP56581 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TdgP56581 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms