Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lim2P56563 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lim2P56563 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lim2P56563 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lim2P56563 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lim2P56563 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lim2P56563 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lim2P56563 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lim2P56563 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lim2P56563 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lim2P56563 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lim2P56563 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lim2P56563 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lim2P56563 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Lim2P56563 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lim2P56563 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lim2P56563 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lim2P56563 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lim2P56563 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lim2P56563 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lim2P56563 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lim2P56563 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lim2P56563 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lim2P56563 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lim2P56563 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lim2P56563 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Lim2P56563 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lim2P56563 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lim2P56563 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lim2P56563 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lim2P56563 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lim2P56563 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lim2P56563 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lim2P56563 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lim2P56563 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lim2P56563 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lim2P56563 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lim2P56563 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lim2P56563 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lim2P56563 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lim2P56563 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lim2P56563 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lim2P56563 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lim2P56563 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lim2P56563 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lim2P56563 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lim2P56563 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lim2P56563 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lim2P56563 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lim2P56563 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lim2P56563 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lim2P56563 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lim2P56563 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lim2P56563 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lim2P56563 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lim2P56563 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lim2P56563 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lim2P56563 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lim2P56563 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lim2P56563 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lim2P56563 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lim2P56563 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lim2P56563 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lim2P56563 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lim2P56563 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lim2P56563 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lim2P56563 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lim2P56563 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lim2P56563 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lim2P56563 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lim2P56563 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lim2P56563 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lim2P56563 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lim2P56563 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lim2P56563 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lim2P56563 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lim2P56563 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lim2P56563 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lim2P56563 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lim2P56563 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lim2P56563 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lim2P56563 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Lim2P56563 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lim2P56563 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lim2P56563 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lim2P56563 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lim2P56563 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lim2P56563 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lim2P56563 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lim2P56563 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lim2P56563 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lim2P56563 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lim2P56563 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lim2P56563 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lim2P56563 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lim2P56563 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lim2P56563 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Lim2P56563 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lim2P56563 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lim2P56563 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms