Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd38P56528 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd38P56528 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cd38P56528 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd38P56528 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd38P56528 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd38P56528 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd38P56528 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd38P56528 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd38P56528 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd38P56528 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd38P56528 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd38P56528 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd38P56528 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd38P56528 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd38P56528 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd38P56528 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd38P56528 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd38P56528 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd38P56528 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd38P56528 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd38P56528 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd38P56528 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd38P56528 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd38P56528 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd38P56528 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd38P56528 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd38P56528 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd38P56528 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd38P56528 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd38P56528 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd38P56528 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd38P56528 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd38P56528 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd38P56528 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd38P56528 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd38P56528 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd38P56528 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd38P56528 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd38P56528 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd38P56528 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd38P56528 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd38P56528 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd38P56528 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd38P56528 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd38P56528 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd38P56528 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd38P56528 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd38P56528 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd38P56528 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd38P56528 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd38P56528 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd38P56528 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd38P56528 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd38P56528 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd38P56528 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd38P56528 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd38P56528 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd38P56528 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd38P56528 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms