Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irf5P56477 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irf5P56477 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irf5P56477 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irf5P56477 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Irf5P56477 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irf5P56477 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Irf5P56477 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Irf5P56477 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Irf5P56477 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Irf5P56477 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Irf5P56477 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Irf5P56477 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irf5P56477 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irf5P56477 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irf5P56477 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irf5P56477 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irf5P56477 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irf5P56477 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irf5P56477 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irf5P56477 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irf5P56477 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irf5P56477 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irf5P56477 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irf5P56477 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irf5P56477 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Irf5P56477 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Irf5P56477 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Irf5P56477 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Irf5P56477 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Irf5P56477 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Irf5P56477 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Irf5P56477 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Irf5P56477 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Irf5P56477 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Irf5P56477 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Irf5P56477 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Irf5P56477 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Irf5P56477 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Irf5P56477 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Irf5P56477 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irf5P56477 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irf5P56477 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irf5P56477 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irf5P56477 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irf5P56477 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irf5P56477 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irf5P56477 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irf5P56477 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irf5P56477 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irf5P56477 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irf5P56477 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irf5P56477 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irf5P56477 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irf5P56477 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irf5P56477 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irf5P56477 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irf5P56477 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irf5P56477 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irf5P56477 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Irf5P56477 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Irf5P56477 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Irf5P56477 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Irf5P56477 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Irf5P56477 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Irf5P56477 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Irf5P56477 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Irf5P56477 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Irf5P56477 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Irf5P56477 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Irf5P56477 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Irf5P56477 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Irf5P56477 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Irf5P56477 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Irf5P56477 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Irf5P56477 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Irf5P56477 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Irf5P56477 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Irf5P56477 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Irf5P56477 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Irf5P56477 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irf5P56477 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irf5P56477 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irf5P56477 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Irf5P56477 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irf5P56477 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irf5P56477 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irf5P56477 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irf5P56477 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irf5P56477 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
Irf5P56477 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irf5P56477 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irf5P56477 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irf5P56477 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irf5P56477 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irf5P56477 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irf5P56477 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irf5P56477 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irf5P56477 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irf5P56477 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms