Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pex2P55098 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pex2P55098 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pex2P55098 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pex2P55098 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pex2P55098 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pex2P55098 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pex2P55098 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pex2P55098 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pex2P55098 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pex2P55098 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pex2P55098 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pex2P55098 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Pex2P55098 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pex2P55098 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pex2P55098 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Pex2P55098 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Pex2P55098 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pex2P55098 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pex2P55098 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pex2P55098 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pex2P55098 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pex2P55098 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pex2P55098 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pex2P55098 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pex2P55098 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pex2P55098 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pex2P55098 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Pex2P55098 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pex2P55098 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pex2P55098 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pex2P55098 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pex2P55098 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pex2P55098 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pex2P55098 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pex2P55098 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pex2P55098 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pex2P55098 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pex2P55098 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pex2P55098 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pex2P55098 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pex2P55098 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pex2P55098 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pex2P55098 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pex2P55098 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pex2P55098 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pex2P55098 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pex2P55098 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pex2P55098 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pex2P55098 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pex2P55098 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pex2P55098 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Pex2P55098 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pex2P55098 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pex2P55098 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pex2P55098 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Pex2P55098 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Pex2P55098 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pex2P55098 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pex2P55098 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pex2P55098 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pex2P55098 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pex2P55098 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pex2P55098 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pex2P55098 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pex2P55098 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pex2P55098 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pex2P55098 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pex2P55098 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pex2P55098 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pex2P55098 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pex2P55098 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pex2P55098 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pex2P55098 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pex2P55098 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pex2P55098 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pex2P55098 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pex2P55098 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pex2P55098 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pex2P55098 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pex2P55098 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms