Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CtskP55097 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CtskP55097 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CtskP55097 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CtskP55097 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CtskP55097 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CtskP55097 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CtskP55097 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CtskP55097 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CtskP55097 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CtskP55097 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CtskP55097 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CtskP55097 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CtskP55097 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CtskP55097 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CtskP55097 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CtskP55097 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CtskP55097 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CtskP55097 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CtskP55097 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CtskP55097 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CtskP55097 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CtskP55097 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CtskP55097 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CtskP55097 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CtskP55097 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CtskP55097 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CtskP55097 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CtskP55097 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CtskP55097 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CtskP55097 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CtskP55097 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CtskP55097 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CtskP55097 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CtskP55097 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CtskP55097 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CtskP55097 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CtskP55097 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CtskP55097 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CtskP55097 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CtskP55097 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CtskP55097 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CtskP55097 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CtskP55097 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CtskP55097 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CtskP55097 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CtskP55097 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CtskP55097 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CtskP55097 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CtskP55097 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CtskP55097 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CtskP55097 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CtskP55097 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CtskP55097 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CtskP55097 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CtskP55097 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CtskP55097 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CtskP55097 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CtskP55097 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CtskP55097 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CtskP55097 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CtskP55097 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CtskP55097 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CtskP55097 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CtskP55097 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CtskP55097 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CtskP55097 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CtskP55097 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CtskP55097 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CtskP55097 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CtskP55097 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CtskP55097 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CtskP55097 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CtskP55097 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CtskP55097 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CtskP55097 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CtskP55097 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CtskP55097 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CtskP55097 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CtskP55097 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CtskP55097 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CtskP55097 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CtskP55097 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CtskP55097 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CtskP55097 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CtskP55097 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CtskP55097 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CtskP55097 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CtskP55097 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CtskP55097 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CtskP55097 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CtskP55097 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CtskP55097 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CtskP55097 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CtskP55097 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CtskP55097 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CtskP55097 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CtskP55097 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CtskP55097 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CtskP55097 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms