Protein–RNA interactions for Protein: P53811

Pitpnb, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PitpnbP53811 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PitpnbP53811 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms